Walaupun peralatan pembersihan laser mempunyai banyak kelebihan, termasuk ketepatan, kecekapan, dan keramahan alam sekitar, terdapat kelemahan tertentu pada teknologi ini.
Satu kelemahan ketara mesin pembersihan laser ialah kosnya yang tinggi, yang mungkin memerlukan pelaburan awal yang besar.
Tambahan pula, pembersihan laser boleh memakan masa, terutamanya apabila berurusan dengan permukaan yang rumit atau lokasi yang sukar dicapai. Akhir sekali, peranti pembersihan laser memerlukan latihan khusus untuk berfungsi dengan baik, yang mungkin meningkatkan kos keseluruhan dan kerumitan penggunaan teknologi ini.
Walaupun menghadapi cabaran ini, mesin pembersihan laser kekal sebagai alat yang berkesan untuk pelbagai aplikasi perindustrian dan komersil, dan faedahnya selalunya mengatasi kelemahannya.